CD6 是一种 I 型跨膜糖蛋白，包含一个 24 氨基酸信号序列、三个细胞外清道夫受体富含半胱氨酸 (SRCR) 结构域、一个跨膜结构域和一个 44 氨基酸胞质结构域。CD6 糖蛋白在 TCR 介导的 T 细胞活化过程中被酪氨酸磷酸化。CD6 显示出与 CD5 的显着同源性。CD6 存在于成熟胸腺细胞、外周 T 细胞和一部分 B 细胞上。CD6 抗体用于清除骨髓移植物中的 T 细胞，以预防移植物抗宿主病。