同种型特异性抗体（例如，山羊抗小鼠 IgG1、山羊抗小鼠 IgG2a 或山羊抗小鼠 IgG2b）可用于特异性检测所列子类的一抗。这对于使用不同同种型的多种小鼠单克隆抗体进行多重检测非常有用。

在用小鼠单克隆抗体对小鼠组织进行染色时，抗小鼠亚型特异性二抗也可用于避免背景，因为 IgG 在大多数小鼠组织中的含量相对较低。

同种型特异性抗体也可用于鉴定单克隆抗体的同种型，或用于染色 B 细胞亚群。