尽管 RIN 编号可以提供有关样本碎片化程度的一般信息，但它的灵敏度或可预测性不足以作为下游性能的有用指标，尤其是对于 RNA-Seq。通常，FFPE 衍生 RNA 的 RIN 编号在 2 到 3 之间。这些样本中的一些对 RNA-Seq 有用，而其他样本则不会——但是 RIN 不会告诉您。

使用 Illumina 测序的 RNA-Seq 性能稍微更好的预测指标是 DV200，它代表长于 200 个核苷酸的 RNA 片段的百分比。DV200 也是根据 Bioanalyzer 数据计算的，但与所有基于 Bioanalyzer 的方法具有相同的缺点，特别是高可变性。