GelRed® 和 GelGreen® 可用于染色 ssDNA 和 RNA，但 GelRed® 对单链核酸的灵敏度比 GelGreen® 高 5 倍左右。使用荧光酶标仪的滴定分析表明，与 ssDNA 和 RNA 结合的 GelRed® 的荧光信号大约是与 dsDNA 结合的 GelRed® 的荧光信号的一半。