CF® 染料是蛋白质标记的理想选择，因为它们具有高水溶性，可减少荧光猝灭。它们也可用于标记需要多个染料拷贝以获得最大荧光的寡核苷酸，例如 FISH 探针的制备，其中水溶性染料可以最大限度地减少荧光猝灭。最后，CF® 染料可制成出色的极性示踪剂，可用于显微注射后神经元的形态可视化或长期示踪。CF® 染料及其偶联物是荧光显微镜应用、流式细胞术、蛋白质印迹和体内成像（近红外 CF® 染料）的理想选择。