CellBrite® 细胞质膜染料等亲脂性羰花青染料可能会对组织切片或器官培养物进行染色，但由于它们的亲脂性，它们可能不会穿透厚组织切片中的多个细胞层。这些染料已用于类器官中的细胞追踪和标记水凝胶培养物。然而，对于这种应用，通常在将细胞置于类器官培养物或嵌入水凝胶之前对细胞进行标记。

这类染料已广泛用于生物体、组织切片、果蝇胚胎和鸡胚胎的神经元追踪，通过显微注射或用固体染料晶体进行点标记。神经元追踪也可以在甲醛固定的组织或胚胎中进行。

Matrigel 是康宁公司的注册商标。